La prednisone supprime souvent temporairement les symptômes, en particulier aux premiers stades de la maladie, et en réduisant l’inflammation, elle peut également retarder la cicatrisation (fibrose) dans les poumons. Cependant, le seul traitement à long terme recommandé est d’éviter les protéines aviaires qui déclenchent la BFL. À moins que la fibrose n’ait progressé au-delà de la guérison, les symptômes devraient s’améliorer, parfois de manière spectaculaire, en l’absence de tels allergènes. Par conséquent, il est conseillé de retirer tous les oiseaux, la literie et les oreillers contenant des plumes du domicile du patient, ainsi que tous les vêtements d’extérieur et sacs de couchage remplis de duvet. Au minimum, il est également conseillé de laver tous les tissus d’ameublement, les murs, les plafonds et les meubles, et d’éviter toute exposition future aux oiseaux, aux fientes d’oiseaux ou à tout article contenant des plumes, comme les oreillers dans de nombreux hôtels. Dans des cas extrêmes, il peut être conseillé aux patients d’évacuer définitivement leur domicile et de se débarrasser de tous les biens qui ont été exposés aux protéines aviaires s’ils ne peuvent pas être nettoyés à fond à l’intérieur et à l’extérieur. (Cela inclut les livres, les lits et les meubles rembourrés.) Le patient ne doit pas tenter de nettoyer les objets contaminés; en fait, toute personne qui entre en contact avec des objets qui ont été près des oiseaux doit changer de vêtements et se laver les cheveux avant d’entrer en contact avec le patient. Selon l’étendue de la fibrose au moment de leur diagnostic et la façon dont ils suivent les protocoles de traitement recommandés (en particulier l’évitement des allergènes), de nombreux patients atteints de BFL se rétablissent complètement. Cependant, les symptômes peuvent réapparaître rapidement lors d’une nouvelle exposition aux oiseaux ou aux allergènes apparentés.