Web designatedit

ett nytt PubMed-gränssnitt lanserades i oktober 2009 och uppmuntrade användningen av sådana snabba, Google-liknande sökformuleringar; de har också beskrivits som ’telegram’ – sökningar. Som standard sorteras resultaten efter senaste, men detta kan ändras till bästa matchning, Publiceringsdatum, första författare, sista författare, tidskrift eller titel.

PubMed webbdesign och domän uppdaterades i januari 2020 och blev standard den 15 maj 2020 med de uppdaterade och nya funktionerna. Det var en kritisk reaktion från många forskare som ofta använder webbplatsen.

PubMed för handdatorer / mobilesEdit

PubMed / Medline kan nås via handhållna enheter, till exempel med alternativet ”PICO” (för fokuserade kliniska frågor) som skapats av NLM. Ett” PubMed Mobile ” – alternativ, som ger tillgång till en mobilvänlig, förenklad PubMed-version, finns också.

SearchEdit

Standard searchEdit

enkla sökningar på PubMed kan utföras genom att ange viktiga aspekter av ett ämne i Pubmeds sökfönster.

PubMed översätter denna ursprungliga sökformulering och lägger automatiskt till fältnamn, relevanta MeSH-termer (medicinska ämnesrubriker), synonymer, Booleska operatörer och ’bon’ de resulterande termerna på lämpligt sätt, vilket förbättrar sökformuleringen avsevärt, särskilt genom att rutinmässigt kombinera (med hjälp av or-operatören) textord och MeSH-termer.

exemplen som ges i en PubMed-handledning visar hur denna automatiska process fungerar:

orsakar sömnvandring är översatt som (”etiologi” eller ”etiologi” eller ”orsaker” eller ”orsakssamband” eller ”orsakssamband” eller (”sömn” och ”promenader”) eller”sömnvandring”)

likaså

soft attack aspirin Prevention översätts som (”myokardinfarkt”eller (”myokardinfarkt”och”infarkt”) eller”hjärtinfarkt” eller (”hjärta” och ”attack”) eller”hjärtattack”) och (”aspirin” eller ”aspirin”) och (”förebyggande och kontroll” eller (”förebyggande” och”kontroll”) eller”förebyggande och kontroll ”eller ” förebyggande”)

Comprehensive searchEdit

för optimala sökningar i PubMed är det nödvändigt att förstå dess kärnkomponent, MEDLINE och särskilt av MeSH (medicinska ämnesrubriker) kontrollerade ordförråd som används för att indexera Medline-artiklar. De kan också kräva komplexa sökstrategier, användning av fältnamn (taggar), korrekt användning av gränser och andra funktioner; referensbibliotekarier och sökspecialister erbjuder söktjänster.

sökningen i Pubmeds sökfönster rekommenderas endast för sökning av entydiga ämnen eller nya interventioner som ännu inte har skapat en Nätrubrik, liksom för sökning efter kommersiella märken av läkemedel och egennamn. Det är också användbart när det inte finns någon lämplig rubrik eller deskriptorn representerar en partiell aspekt. Sökningen med hjälp av tesaurus-nätet är mer exakt och ger färre irrelevanta resultat. Dessutom sparar det nackdelen med fritextsökning där stavning, singular/plural eller förkortade skillnader måste beaktas. Å andra sidan kommer artiklar som nyligen införlivats i databasen som deskriptorer ännu inte har tilldelats inte att hittas. För att garantera en uttömmande sökning måste därför en kombination av kontrollerade språkrubriker och fritextermer användas.

Tidskriftsartikel parametersEdit

När en tidskriftsartikel indexeras extraheras och lagras många artikelparametrar som strukturerad information. Sådana parametrar är: artikeltyp (MeSH-termer, t.ex. ”klinisk prövning”), sekundära identifierare, (MeSH-termer), språk, tidskriftens land eller publikationshistorik (e-publiceringsdatum, publiceringsdatum för tryckta tidskrifter).

Publiceringstyp: kliniska frågor/systematiska granskningarredigera

Publiceringstyp parameter tillåter sökning efter typ av publikation, inklusive rapporter om olika typer av klinisk forskning.

sekundär IDEdit

sedan juli 2005 extraherar Medline-artikelindexeringsprocessen identifierare från artikelabstraktet och sätter dem i ett fält som kallas sekundär identifierare (SI). Fältet sekundär identifierare är att lagra anslutningsnummer till olika databaser med molekylära sekvensdata, genuttryck eller kemiska föreningar och kliniska prövnings-ID. För kliniska prövningar extraherar PubMed försöks-ID för de två största försöksregistren: ClinicalTrials.gov (NCT identifier) och International Standard Randomized Controlled Trial Number Register (IRCTN identifier).

se ävenRedigera

en referens som bedöms särskilt relevant kan markeras och” relaterade artiklar ” kan identifieras. Om det är relevant kan flera studier väljas och relaterade artiklar till dem alla kan genereras (på PubMed eller någon av de andra NCBI Entrez-databaserna) med alternativet Hitta relaterade data. De relaterade artiklarna listas sedan i ordning med ”relatedness”. För att skapa dessa listor med relaterade artiklar jämför PubMed ord från titeln och abstraktet för varje citat, liksom de Maskrubriker som tilldelats, med hjälp av en kraftfull ordvägd algoritm. Funktionen relaterade artiklar har bedömts vara så exakt att författarna till ett papper föreslog att det kan användas istället för en fullständig sökning.

mappning till MeSHEdit

PubMed länkar automatiskt till MeSH-termer och underrubriker. Exempel skulle vara: ”dålig andedräkt” länkar till (och inkluderar i sökningen) ”halitos”, ”hjärtinfarkt” till ”hjärtinfarkt”, ”bröstcancer” till ”bröstneoplasmer”. I förekommande fall ”utökas” dessa MeSH-termer automatiskt, det vill säga inkludera mer specifika termer. Termer som” omvårdnad ”kopplas automatiskt till” omvårdnad ”eller ”omvårdnad”. Den här funktionen kallas automatisk Termmappning och antas som standard i fritextsökning men inte exakt frassökning (dvs. omsluter sökfrågan med dubbla citat). Denna funktion gör PubMed-sökningar känsligare och undviker falskt negativa (missade) träffar genom att kompensera för mångfalden av medicinsk terminologi.

PubMed tillämpar inte automatisk kartläggning av termen under följande omständigheter: genom att skriva den citerade frasen (t.ex. ”njurallograft”), när den trunkeras på asterisken (t. ex. njurallograft*) och när man tittar med fältetiketter (t. ex. Cancer).

My NCBIEdit

PubMed valfri anläggning ”My NCBI” (med gratis registrering) ger verktyg för

• spara sökningar
• filtrera sökresultat
• ställa in automatiska uppdateringar som skickas via e-post
• spara uppsättningar referenser hämtas som en del av en PubMed sökning
• konfigurera visningsformat eller markera söktermer

och ett brett utbud av andra alternativ. Området” My NCBI ”kan nås från vilken dator som helst med web-access.An tidigare version av” My NCBI ”kallades”PubMed Cubby”.

LinkOutEdit

LinkOut, en NLM-anläggning för att länka (och göra tillgängliga fulltext) lokala journalinnehav. Cirka 3 200 platser (främst akademiska institutioner) deltar i denna NLM-anläggning (från och med mars 2010), från Aalborg University i Danmark till ZymoGenetics i Seattle. Användare på dessa institutioner ser sin institutions logotyp i PubMed-sökresultatet (om tidskriften hålls på den institutionen) och kan komma åt fulltexten. Link out konsolideras med Outside Tool från och med den stora plattformsuppdateringen som kommer sommaren 2019.

PubMed CommonsEdit

i 2016 tillåter PubMed författare av artiklar att kommentera artiklar indexerade av PubMed. Denna funktion testades ursprungligen i pilotläge (sedan 2013) och gjordes permanent 2016. I februari 2018 avbröts PubMed Commons på grund av att ”användningen har förblivit minimal”.

askMEDLINEEdit

askMEDLINE, en fritext, naturligt språk frågeverktyg för MEDLINE / PubMed, utvecklad av NLM, även lämplig för handdatorer.

PubMed identifierEdit

en PMID (PubMed identifier eller PubMed unique identifier) är ett unikt heltal som börjar vid 1, som tilldelas varje PubMed-post. Ett PMID är inte detsamma som ett Pmcid (PubMed Central identifier) som är identifieraren för alla verk som publiceras i PubMed Central.

tilldelningen av ett PMID eller PMCID till en publikation berättar läsaren ingenting om innehållets typ eller kvalitet. PMIDs tilldelas brev till redaktören, redaktionella åsikter, op-ed kolumner, och alla andra bitar som redaktören väljer att inkludera i tidskriften, samt peer-reviewed papper. Förekomsten av identifikationsnumret är inte heller ett bevis på att handlingarna inte har dragits tillbaka för bedrägeri, inkompetens, eller tjänstefel. Tillkännagivandet om eventuella korrigeringar till originalpapper kan tilldelas en PMID.