nietpathogene organismen zijn organismen die geen ziekte, schade of dood aan een ander organisme veroorzaken en worden gewoonlijk gebruikt om bacteriën te beschrijven. Het beschrijft een eigenschap van een bacterie – zijn vermogen om ziekte te veroorzaken. De meeste bacteriën zijn nietpathogeen. Het kan de aanwezigheid van niet-ziekte veroorzakende bacteriën beschrijven die normaal op de oppervlakte van gewervelde en ongewervelde dieren als commensals verblijven. Sommige nietpathogene micro-organismen zijn commensals op en binnen het lichaam van dieren en worden microbiota genoemd. Sommige van deze zelfde nietpathogene micro-organismen hebben het potentieel van het veroorzaken van ziekte, of pathogeen zijn als ze het lichaam binnenkomen, vermenigvuldigen en symptomen van infectie veroorzaken. Immunogecompromitteerde individuen zijn vooral kwetsbaar voor bacteriën die typisch nietpathogeen zijn maar wegens een gecompromitteerd immuunsysteem, ziekte optreedt wanneer deze bacteriën toegang krijgen tot het binnenland van het lichaam. Genen zijn geà dentificeerd die ziekte en besmetting met nietpathogene bacteriën door een klein aantal personen predisponeren. Nietpathogene E.coli stammen normaal gevonden in het maagdarmkanaal hebben de capaciteit om de immune reactie in mensen te stimuleren, hoewel verdere studies nodig zijn om klinische toepassingen te bepalen.

commensalen vs pathogenen mechanisme. Mechanismen die ten grondslag liggen aan de ontsteking bij COPD. Luchtweg epitheel heeft een complexe structuur: bestaat uit ten minste zeven verschillende celtypes die met elkaar interageren door middel van tight junctions. Bovendien kunnen epitheliale oproepen de signalen in de onderliggende weefsels leveren die aan de mechanismen van ingeboren en adaptieve immune defensie deelnemen. De belangrijkste zenders van de signalen zijn dendritische cellen. Zodra de pathogene bacterie (B. V., S. pneumoniae, P. aeruginosa) bepaalde receptoren van de patroonherkenning op/in epitheliaale cellen heeft geactiveerd, worden de proinflammatory signalerende wegen geactiveerd. Dit resulteert voornamelijk in IL-1, IL-6 en IL-8 productie. Deze cytokines veroorzaken chemotaxis aan de plaats van besmetting in zijn doelcellen (b.v., neutrofielen, dendritische cellen en macrofagen). Anderzijds, veroorzaken vertegenwoordigers van standaard microbiota slechts zwakke signalerende het verhinderen van de ontsteking. Het mechanisme van het onderscheid tussen onschadelijke en schadelijke bacteriën op zowel moleculaire als fysiologische niveaus is niet volledig begrepen.

een bepaalde bacteriestam kan bij één soort niet pathogeen zijn, maar bij een andere. Eén soort bacterie kan veel verschillende soorten of stammen hebben. Een stam van een bacterie kan niet pathogeen zijn en een andere stam van dezelfde bacterie kan pathogeen zijn.