La termometría rectal es ampliamente utilizada en medicina veterinaria y pediatría, así como por adultos en el hogar que desean la lectura de temperatura más precisa posible y pasan por alto la naturaleza invasiva asociada con el procedimiento indoloro. Se logra insertando la punta de un termómetro, generalmente lubricado con lubricante personal para eliminar la fricción y ayudar en la inserción más allá del esfínter anal firmemente retentivo, a una profundidad de, para un adulto de 1,5 pulgadas (3,8 cm), o para un niño entre ambos .5 y 1 pulgada (1,3 y 2.5 cm). La punta del termómetro se debe dejar en su lugar hasta que se pueda obtener una lectura, generalmente unos 3 minutos para los termómetros de mercurio y 1 minuto para los tipos electrónicos más nuevos. Es importante recordar que el rango normal de temperatura central humana medido con un termómetro rectal abarca de 98,6 a 100,4 grados Fahrenheit (37,0 a 38,0 grados Celsius).
Los termómetros rectales a menudo son de color rojo cereza para diferenciarlos de los termómetros orales o axilares, así como tienen una forma más corta, en cuclillas, pera o bulbo rechoncho. No están destinados a ser utilizados indistintamente con otros tipos de termómetros.