Dal 1990 si sono verificati cambiamenti drammatici nella classificazione dei funghi. Una migliore comprensione delle relazioni dei funghi tradizionalmente collocati nei phyla Chytridiomycota e Zygomycota ha portato alla dissoluzione di taxon obsoleti e alla generazione di nuovi taxon. Il Chytridiomycota è mantenuto ma in senso limitato. Uno degli ordini tradizionali di Chytridiomycota, i Blastocladiales, è stato elevato allo status di phylum come Blastocladiomycota. Similmente, il gruppo di chytrids anaerobici del rumine, precedentemente conosciuto come ordine Neocallimastigales, è stato riconosciuto come un phylum distinto, il Neocallimastigomycota. Il phylum Zygomycota non è accettato nella classificazione filogenetica dei funghi a causa dei dubbi rimanenti sulle relazioni tra i gruppi che sono stati tradizionalmente collocati in questo phylum. Le conseguenze di questa decisione sono il riconoscimento del phylum Glomeromycota e di quattro subphyla incertae sedis (in latino “di posizione incerta”): Mucoromycotina, Kickxellomycotina, Zoopagomycotina ed Entomophthoromycotina.
Larry C. Luna/Tom Stack & Collaboratori
La vera funghi, che compongono il clade monofiletico chiamato regno dei Funghi, composto da sette phyla: Chytridiomycota, Blastocladiomycota, Neocallimastigomycota, Microsporidi, Glomeromycota, Ascomycota, e Basidiomycota (questi ultimi due sono combinati in subkingdom Dikarya). Il gruppo di funghi ancestrali si pensa sia rappresentato dall’attuale Chytridiomycota, anche se i Microsporidi potrebbero essere un gruppo fratello altrettanto antico. I primi passi importanti nell’evoluzione dei funghi superiori furono la perdita del flagello chytrid e lo sviluppo di filamenti fungini ramificati e asettici, che si verificarono quando i funghi terrestri divergevano dalle muffe dell’acqua 600 milioni a 800 milioni di anni fa. I filamenti settati si sono evoluti quando il Glomeromycota si è differenziato da un clade combinato di funghi pre-basidiomycota e pre-ascomycota circa 500 milioni di anni fa. Hy con l’aspetto caratteristico del moderno Basidiomycota può essere visto in alcuni dei primi esemplari noti di fossili vegetali. Pertanto, Ascomycota e Basidiomycota probabilmente divergevano come cosiddetti gruppi fratelli, che sono posti insieme in subkingdom Dikarya, circa 300 milioni di anni fa. I funghi facilmente riconoscibili probabilmente si diversificarono da 130 milioni a 200 milioni di anni fa, subito dopo che le piante da fiore divennero una parte importante della flora e ben prima dell’età dei dinosauri. Una radiazione evolutiva relativamente recente, forse 60 milioni a 80 milioni di anni fa, di Chytridiomycota anaerobica si è verificato come erbe e mammiferi al pascolo è diventato più abbondante; i funghi chytrid fungono da simbionti all’interno del rumine di tali animali, consentendo così ai mammiferi al pascolo di digerire le erbe.
David Moore