De Lewis & Clark College

probabil ați auzit legenda urbană: păianjenii cu picioare lungi au venin extrem de toxic-atât de toxic încât ar ucide un om dacă numai colții lor ar fi suficient de lungi / puternici pentru a pătrunde în pielea umană.după mai mult de un deceniu de cercetări, profesorul de Biologie Greta Binford și asociatul de cercetare și profesorul invitat Pamela Zobel-Thropp au descoperit pentru prima dată ce se află în veninul acestor animale și au compilat dovezi ale efectelor veninelor lor asupra oamenilor. Noile dovezi zdrobesc vechea legendă urbană.într-o nouă lucrare de cercetare, „Not So Dangerous After all”, publicată în revista Frontiers in Evolution and Ecology, Binford și Zobel-Thropp detaliază analiza lor chimică a veninului pholcid (cunoscut în mod obișnuit sub numele de păianjeni de pivniță sau tati picioare lungi). Rezultatele lor arată că veninul este plin de proteine și peptide interesante și este foarte toxic pentru insecte, dar toate dovezile indică faptul că are o toxicitate neglijabilă asupra mamiferelor, în special în comparație cu veninul văduvei negre, de exemplu.

în 2014, serialul de succes Discover Network MythBusters și-a luat libertatea de a risipi mitul lui daddy Long-legs cu venin din aceeași specie și supravegheat de Chuck Kristensen, coautor al acestei lucrări; cu toate acestea, până la publicarea lucrării lui Binford, nu a existat o analiză riguroasă a ceea ce este în veninul vreunui păianjen pholcid.

finanțat printr-un grant de la Institutele Naționale de sănătate din 2011, lucrarea detaliază căutarea diligentă a echipei de dovezi solide. Pentru a ajunge la descoperirile lor, echipa a analizat compoziția veninului unei specii de pholcid, care conține peste 120 de proteine și peptide diferite care contribuie la toxicitate. „în loc să ne temem de picioarele lungi ale tatălui, suntem inspirați de potențialul de descoperire a unor noi activități chimice în aceste veninuri”, a spus Binford. „Ele reprezintă o ramură rece, puțin studiată și diversă a biodiversității din care avem multe de învățat.”

pentru a realiza analiza, echipa s-a bazat pe tehnologii pentru secvențierea cu randament ridicat și „proteomică.”Această lucrare a inspirat tehnologia clădirii și o echipă de asistență la Lewis & Clark pentru calculul de înaltă performanță.

datorită sprijinului oferit de Jeremy McWilliams la Lewis& Biroul de inițiative digitale al Bibliotecii Watzek din Clark, echipa a folosit clusterul HPC al Colegiului (numit cu dragoste BLT pentru cele trei servere ale sale: slănină, salată verde și roșii—mai bine împreună) pentru a analiza datele analizând 9 proteomi și 22 transcriptomi. Utilizarea calculelor de înaltă performanță nu numai că a oferit perspective și descoperiri altfel inaccesibile, ci s-a dovedit, de asemenea, neprețuită în formarea studenților-cercetători.

„posibilitatea practică pentru studenții noștri de a utiliza calculul de înaltă performanță le extinde abilitățile analitice și le permite să fie mai puțin limitați în sfera întrebărilor pe care le pot pune și răspunde”, a spus Binford. „De asemenea, ne oferă șansa de a învăța elevii cum să evalueze critic dovezile provenite din analizele „big data”.””

echipa sa de cercetare a inclus studenți (atât actuali, cât și absolvenți), colaboratori din alte instituții de învățământ superior și chiar un elev local de liceu.

„a face parte din echipa de cercetare a Gretei a fost unul dintre cele mai mari privilegii pe care le-am avut în viața mea”, a spus Jennifer Mullins BA ’12, care lucrează acum în administrația Sănătății din vestul Washingtonului. „Venind dintr-un mediu defavorizat, m-am simțit întotdeauna ca și cum aș fi fost în spatele colegilor mei de la Lewis & Clark. Astfel, când am aplicat pentru postul râvnit de coleg al lui Roger în laboratorul Binford, eram sigur că eram cel mai puțin probabil candidat. Dar Greta m-a ales pe mine și mi-a permis să continui un proiect pe care l-am început în laboratorul ei cu semestrul anterior, cercetând mitul lui daddy Long-legs venom. Ce etaje mine este ea lasă-mă să vină cu proiectul pe cont propriu și este o nebunie pentru mine să mă gândesc cum a ajuns la îndeplinire.Binford se grăbește să-și crediteze toți colaboratorii de cercetare, inclusiv coautorul de hârtie Chuck Kristensen, pe care îl numește în glumă „dealer venom.”Kristensen operează Spider Pharm, o companie din Arizona care întreține nenumărate colonii de specii de păianjeni și produce venin pentru cercetare și producție de antivenin, inclusiv speciile pholcidae utilizate în cercetarea Binford. Binford ‘s spider research a apărut în The New Yorker, PBS’ s NOVA series și NPR ‘ s Science Friday, pentru a numi doar câteva. În 2011, a fost numită Profesorul Anului din Oregon. Un arahnolog și păianjen-femeie prin și prin, Binford are chiar și o specie de păianjen numită pentru ea (Austrarchaea Binford). Mullins a spus: „Există multe momente care s—au remarcat în experiența mea de lucru cu echipa de cercetare Binford—navigând în Caraibe prinzând arahnide, educație pentru orfanii Dominicani și refugiații haitieni-dar ceea ce a avut cel mai mare impact asupra vieții mele este doar ca Greta să-mi dea șansa de a face parte din echipă. A avea pe cineva care să creadă în tine face diferența.”