PubMed

Website designEdit

uma nova interface PubMed foi lançada em outubro de 2009 e encorajou o uso de formulações de pesquisa rápidas, semelhantes ao Google; elas também foram descritas como pesquisas “telegram”. Por padrão, os resultados são ordenados pela mais recente, mas isso pode ser alterado para melhor correspondência, Data de publicação, primeiro autor, último autor, revista ou título.

O design e domínio do site PubMed foi atualizado em janeiro de 2020 e tornou-se padrão em 15 de Maio de 2020, com os recursos atualizados e novos. Houve uma reação crítica de muitos pesquisadores que freqüentemente usam o site.

PubMed for handhelds / mobilesEdit

PubMed / MEDLINE can be accessed via handheld devices, using for instance the “PICO” option (for focused clinical questions) created by the NLM. Também está disponível uma opção” PubMed Mobile”, que permite o acesso a uma versão PubMed móvel amigável e simplificada.

SearchEdit

Searchedit padrão

pesquisas simples em PubMed podem ser realizadas inserindo aspectos chave de um assunto na janela de pesquisa de PubMed.

PubMed traduz esta formulação de pesquisa inicial e adiciona automaticamente nomes de campos, Termos de malha relevante (rubricas de Assuntos Médicos), sinônimos, operadores booleanos, e ‘ninhos’ os Termos resultantes adequadamente, melhorando significativamente a formulação de pesquisa, em particular através da combinação rotineira (usando o ou operador) de palavras de texto e termos de malha.

os exemplos dados em um tutorial PubMed demonstram como este processo automático funciona:

Faz com que o Sono Andar a pé é traduzido como”etiologia” OU “etiologia” OU “causas” OU “causalidade” OU “causalidade”) E (“somnambulism” OU “somnambulism” OU (“sono” E “pé”) OU “sonambulismo”)

da Mesma forma,

soft Attack Aspirina Prevenção é traduzido como”infarto do miocárdio” OU (“infarto” E “infarto”) OU “enfarte do miocárdio” OU (“coração” E “ataque”) OU “ataque do coração”) E (“aspirina” OU “aspirina”) E (“prevenção e controle” OU (“prevenção” E “controle”) OU “prevenção e o controle” OU “prevenção”)

Abrangente searchEdit

Para melhor buscas no PubMed, é necessário compreender a sua componente principal, MEDLINE, e, especialmente, do MeSH (Medical Subject Headings) vocabulário controlado usado para indexar MEDLINE artigos. Eles também podem exigir estratégias de busca complexas, uso de nomes de campo (tags), uso adequado de limites e outras características; bibliotecários de referência e especialistas em busca oferecem serviços de busca.

a pesquisa na janela de pesquisa do PubMed só é recomendada para a busca de tópicos inequívocos ou novas intervenções que ainda não têm uma rubrica de malha criada, bem como para a busca de marcas comerciais de medicamentos e substantivos adequados. É igualmente útil quando não existe um título adequado ou quando o descritor representa um aspecto parcial. A pesquisa usando a malha do thesaurus é mais precisa e dará menos resultados irrelevantes. Além disso, ele salva a desvantagem da pesquisa de texto livre em que a ortografia, diferenças singulares/plurais ou abreviadas têm que ser tomadas em consideração. Por outro lado, os artigos mais recentemente incorporados na base de dados aos quais ainda não foram atribuídos descritores não serão encontrados. Portanto, para garantir uma busca exaustiva, deve ser utilizada uma combinação de rubricas linguísticas controladas e termos de texto livre.

Journal article parametersEdit

When a journal article is indexed, numerous article parameters are extracted and stored as structured information. Tais parâmetros são: tipo de artigo (Termos MeSH, por exemplo, “ensaio clínico”), identificadores secundários, (Termos MeSH), Língua, País da revista ou história da publicação (data de publicação e, data de publicação da revista impressa).

tipo de publicação: consultas clínicas/revisão sistemática edit

parâmetro do tipo de publicação permite a pesquisa pelo tipo de publicação, incluindo relatórios de vários tipos de investigação clínica.

Idedit secundário

desde julho de 2005, o processo de indexação do artigo MEDLINE extrai identificadores do artigo abstrato e coloca-os num campo chamado identificador secundário (SI). O campo Identificador secundário é armazenar números de adesão a várias bases de dados de sequência molecular, expressão de genes ou compostos químicos e IDs de ensaios clínicos. Para ensaios clínicos, IDs de ensaios de extractos PubMed para os dois maiores registos de ensaios: ClinicalTrials.gov (NCT identifier) e o International Standard Randomized Controlled Trial Number Register (IRCTN identifier).

ver tambémedit

uma referência considerada particularmente relevante pode ser marcada e” artigos relacionados ” podem ser identificados. Se relevante, podem ser selecionados vários estudos e gerados artigos relacionados a todos eles (em PubMed ou em qualquer das outras bases de dados NCBI Entrez) utilizando a opção “Encontrar dados relacionados”. Os artigos relacionados são então listados por ordem de”parentesco”. Para criar essas listas de artigos relacionados, PubMed compara palavras do título e abstrato de cada citação, bem como os cabeçalhos de malha atribuídos, usando um poderoso algoritmo de ponderação palavra. A função “artigos relacionados” foi considerada tão precisa que os autores de um artigo sugeriram que ele pode ser usado em vez de uma pesquisa completa.

mapeamento para MeSHEdit

PubMed automaticamente ligações às malhas e subposições. Exemplos seriam:” mau hálito ” links para (e inclui na busca) “halitose”, “ataque cardíaco” para “enfarte do miocárdio”, “câncer de mama” para “neoplasmas da mama”. Quando apropriado, estes Termos de malha são automaticamente “expandidos”, ou seja, incluem termos mais específicos. Termos como” enfermagem “são automaticamente ligados a” enfermagem “ou “Enfermagem”. Esta característica é chamada de mapeamento Auto Termo e é promulgada, por padrão, na busca de texto livre, mas não a busca de frase exata (ou seja, cercando a consulta de pesquisa com aspas duplas). Esta característica torna as buscas PubMed mais sensíveis e evita erros falsos-negativos compensando a diversidade da terminologia médica.

PubMed não aplica mapeamento automático do termo nas seguintes circunstâncias: escrevendo a frase citada (por exemplo, “transplante renal”), quando truncado no asterisco (por exemplo, transplante renal*), e ao olhar com etiquetas de campo (por exemplo, câncer ).

o Meu NCBIEdit

O PubMed funcionalidade opcional “My NCBI” (com inscrição gratuita) fornece ferramentas para

  • salvar pesquisas
  • filtragem de resultados de pesquisa
  • configuração de atualizações automáticas enviadas pelo e-mail
  • economia de conjuntos de referências obtidas como parte de um PubMed de pesquisa
  • configuração de formatos de exibição ou destacar termos de pesquisa

e uma ampla gama de outras opções. A área” My NCBI “pode ser acessada a partir de qualquer computador com web-access.An a versão anterior de” My NCBI “foi chamada de”PubMed Cubby”.

LinkOutEdit

LinkOut, uma instalação da NLM para ligar (e disponibilizar texto completo) as detenções de jornais locais. Cerca de 3200 locais (principalmente instituições académicas) participam nesta instalação da NLM (a partir de Março de 2010), da Universidade de Aalborg, na Dinamarca, à ZymoGenetics, em Seattle. Os utilizadores destas instituições vêem o logótipo da sua instituição dentro do resultado da pesquisa PubMed (se a revista for realizada nessa instituição) e podem aceder ao texto completo. O Link out está sendo consolidado com a ferramenta externa, a partir da grande atualização da plataforma que vem no verão de 2019.

PubMed CommonsEdit

em 2016, PubMed permite aos autores de artigos comentar sobre artigos indexados pela PubMed. Esta característica foi inicialmente testada em um modo piloto (desde 2013) e tornou-se permanente em 2016. Em fevereiro de 2018, PubMed Commons foi descontinuado devido ao fato de que “o uso permaneceu mínimo”.

askMEDLINEEdit

askMEDLINE, uma ferramenta de consulta em linguagem livre e natural para MEDLINE/PubMed, desenvolvida pela NLM, também adequada para handhelds.

PubMed identifierEdit

para ajuda usando identificadores PubMed dentro do Wikipedia, veja Wikipedia: PMID.

uma PMID (PubMed identifier ou PubMed unique identifier) é um valor inteiro único, começando em 1, atribuído a cada registo PubMed. Um PMID não é o mesmo que um PMCID (PubMed Central identifier) que é o identificador para todos os trabalhos publicados no Free-to-access PubMed Central.

a atribuição de um PMID ou PMCID a uma publicação não diz nada ao leitor sobre o tipo ou qualidade do conteúdo. PMIDs são atribuídos a cartas para o editor, opiniões editoriais, colunas op-ed, e qualquer outra peça que o editor opta por incluir na revista, bem como trabalhos revisados por pares. A existência do número de identificação também não é prova de que os documentos não foram retraídos por fraude, incompetência ou má conduta. O anúncio sobre quaisquer correções em trabalhos originais pode ser atribuído um PMID.

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