Um único Fokker F28 Comunhão twin jet, comprado em julho de 1984, a partir de um Africano transportadora, foi o primeiro jato de propriedade Horizonte Ar (no entanto, o primeiro jato operado pelo Horizonte foi uma molhado alugadas Douglas DC-9-10).uma oferta pública inicial ocorreu em 1985 para garantir o capital de exploração, que após apenas um ano lucrativo desde a sua fundação, era necessária para manter a companhia aérea à tona. Nesse verão, a Horizon entrou em seu primeiro Acordo de codeshare com a United Airlines, e em 8 de setembro, a Horizon assinou um acordo com a De Havilland Canada para começar a comprar a primeira nova aeronave da companhia aérea, A De Havilland Canada Dash 8-100 Twin turboprop.
no final de 1985, a Horizon assinou um acordo para comprar o seu principal concorrente em Washington, Cascade Airways, mas no início de 1986 foram liberados do acordo. As negociações de fusão entre os dois tinham começado no final de 1982.em janeiro de 1986, a companhia aérea tornou-se uma transportadora internacional quando começou a operar em Calgary, Alberta, em associação com a Cascade Airways.a Alaska Airlines fez um acordo para adquirir a Horizon Air em novembro de 1986. No ano anterior, o Alasca tinha sofrido uma grande reestruturação corporativa com a companhia aérea agora sendo propriedade do Alaska Air Group, uma companhia aérea holding. Nos termos do acordo, o Alaska Air Group tornou-se proprietário da Horizon Air após aprovação pelo Departamento de transportes no final de dezembro. O Alaska Air Group continuou a operar a Horizon como uma companhia aérea de marca separada, com um acordo de compartilhamento de codesharing com sua nova companhia aérea irmã, Alasca, ao terminar seu codeshare com a United Airlines.em 1988, a Horizon assinou um acordo de partilha de códigos com a Northwest Airlines.
O Serviço Internacional foi expandido em maio de 1989 com voos para Vancouver e Victoria na Colúmbia Britânica, usando ambos os Dash 8-100s e Fairchild Swearingen Metroliner turbopropulsor.
Horizon foi o cliente de lançamento do turbopropulsor Dornier 328, com a intenção de substituir os Metroliners por esta nova aeronave que prometia velocidade e conforto a par com os jetliners. Em reconhecimento à ordem, Dornier pintou seu segundo protótipo das 328 cores do horizonte. Doze aeronaves foram entregues entre novembro de 1993 e novembro de 1995, mas eles foram rapidamente eliminados em 1997 em favor da padronização da frota para a série Dash 8 de turboprops.ao longo da sua história, a Horizon operou como transportadora independente ou como filial regional da Alaska Airlines durante a maior parte da sua história, excepto entre 2004 e 2007, quando operou aeronaves Bombardier CRJ-700 em nome da Frontier Airlines.
No final de 2010, o Horizonte, a empresa-mãe, o Alasca Ar de Grupo, tomou a decisão de não mais operar Horizonte como separar a companhia aérea regional. A partir de 1 de janeiro de 2011, a Horizon passou a um modelo de negócio do Acordo de compra de capacidade (APG), que nessa altura se tinha tornado o padrão regional da indústria aérea. Ao abrigo da CPA, A Horizon Opera e mantém as suas aeronaves, enquanto a Alaska Airlines é responsável pela programação, comercialização e fixação dos preços de todos os voos. Como parte da mudança para o novo modelo de negócios, a marca Horizon Air foi aposentada e todos os aviões Horizon foram repintados com um uniforme co-marca “Alaska Horizon”.
Alaska Airlines entrou em um acordo de compra de capacidade similar com a SkyWest Airlines em maio de 2011. Como parte do acordo, os gerentes do Alaska Air Group concordaram em vender a frota da Horizon de cinco aviões a jato regionais da Bombardier CRJ-700 para a SkyWest, que usou a aeronave para operar seis rotas da costa oeste como “Alaska SkyWest”. The move left Horizon with a fleet consisting of a single type of aircraft; the Bombardier Dash 8-Q400 turboprop.
Horizonte anunciou, em abril de 2016, que iria expandir sua frota e, mais uma vez operar jatos regionais, a colocação de uma encomenda de 30 a Embraer 175 aviões. A ordem é a maior da história da companhia aérea e mais tarde foi expandida para 33 jatos.
A companhia aérea passou por um período de turbulência em 2017. Em meio a um crescimento sem precedentes (estimulado pela adição da nova aeronave), a Horizon experimentou uma grave escassez de pilotos, forçando a companhia aérea a cancelar centenas de voos e atrasar a entrega de novas aeronaves. A escassez de pilotos fazia parte de um problema mais vasto que afectava todas as companhias aéreas regionais, mas atingiu a Horizon com particular intensidade. Depois que a indústria aérea começou a recuperar em 2013, após uma década de recessão, as transportadoras aéreas da mainline começaram a contratar pilotos, principalmente de transportadoras regionais que oferecem baixos salários e oportunidades limitadas de avanço. Os pilotos regionais mais experientes mudaram-se para linhas principais mais bem pagas. A Horizon respondeu com um aumento drástico de salários para tripulações de voo e trabalhou com a Alaska, sua companhia aérea irmã, para criar mais oportunidades de avanço. Como resultado, há um afluxo de novos pilotos jovens com menos experiência.em resposta à crise, o Alasca deslocou alguns dos seus voos da Horizon para o seu outro parceiro regional, a SkyWest Airlines. Foi um movimento que o CEO da Horizon descreveu como ” desanimador.”Por causa da mudança, SkyWest encomendou 175 aviões adicionais Embraer que ele vai voar para o Alasca.no final do ano conturbado, o CEO da Horizon, Dave Campbell, anunciou que se demitiria em 5 de janeiro de 2018, por razões pessoais. Gary Beck tornou-se CEO em janeiro de 2018. Em novembro de 2019, O ex-aposentado da empresa Joe Sprague retornou à Horizon Air como presidente.a partir de outubro de 2020, a companhia aérea está sediada no subúrbio de Seattle de SeaTac, Washington, não muito longe do Aeroporto Internacional de Seattle–Tacoma, e a principal base de manutenção da companhia aérea está no Aeroporto Internacional de Portland. A Horizon também considera os aeroportos de Seattle–Tacoma e Portland como seus hubs.