przywództwo kwakrów i aktywizm polityczny
po wstąpieniu do sekty, Penn w końcu został uwięziony cztery razy za publiczne wyznanie swoich przekonań w słowach i drukach. W ciągu siedmiu lat bezpośrednio po nawróceniu opublikował 42 książki i broszury. W swojej pierwszej publikacji, the pamphlet Truth Exalted (1668), podtrzymywał doktryny kwakrów, atakując z kolei te Rzymsko-Katolickie, anglikańskie I odmienne kościoły. Po nim powstała Fundacja Sandy (1668), w której śmiało kwestionował Trójcę i inne doktryny protestanckie. Chociaż Penn później zakwalifikował swój antytrynitaryzm jako niewinność z otwartą twarzą (1669), został uwięziony w Tower of London, gdzie napisał swoją najsłynniejszą książkę, No Cross, No Crown (1669). W tym dziele wyeksponował kwakersko-purytańską moralność elokwencją, nauką i błyskami humoru, potępiając światowość i luksus odbudowy Anglii i wychwalając zarówno purytańskie koncepcje ascetycznego samozaparcia, jak i Kwakerskie ideały reform społecznych. Nie ma krzyża, nie ma Korony stoi obok listów św. Pawła, pocieszenia filozofii Boethiusa i postępu Pielgrzyma Jana Bunyana jako jeden z najlepszych na świecie przykładów literatury więziennej. Penn został zwolniony z Wieży w 1669 roku.
To właśnie jako bohater tolerancji religijnej Penn zasłużył sobie na znaczące miejsce w Angielskiej historii. W 1670 roku napisał ponownie „Wielki przypadek Wolności Sumienia”&, który był najbardziej systematycznym i dokładnym eksponatem teorii tolerancji powstałej w Anglii. Chociaż Penn oparł swoje argumenty na teologicznych i biblijnych podstawach, nie przeoczył racjonalnych i pragmatycznych rozważań; wskazał na przykład, że współczesny dobrobyt Holandii opiera się na ” jej pobłażliwości w sprawach wiary i kultu.”
tego samego roku Penn miał również nieoczekiwaną okazję zadać kolejny cios dla wolności sumienia i tradycyjnych praw wszystkich Anglików. 14 sierpnia 1670 roku Quaker meetinghouse na Gracechurch Street w Londynie, po zamknięciu przez władze, wygłosił kazanie na ulicy do kilkuset osób. Po spotkaniach wraz z Williamem Meadem został aresztowany i uwięziony pod zarzutem podżegania do zamieszek. Podczas procesu w Old Bailey, Penn spokojnie i umiejętnie ujawnił bezprawność postępowania przeciwko niemu. Ława przysięgłych pod przewodnictwem Edwarda Bushella odmówiła wydania wyroku skazującego na winę pomimo gróźb i obraźliwego traktowania. Za ich odmowę ławnicy zostali ukarani grzywną i uwięzieni, ale zostali usprawiedliwieni, gdy Sir John Vaughan, lord główny sędzia, sformułował zasadę, że sędzia ” może próbować otworzyć oczy ławnikom, ale nie prowadzić ich za nos.”Proces, znany również jako” sprawa Bushella”, stanowi przełom w Angielskiej historii prawa, ustanawiając ponad wszelką wątpliwość niezależność ławy przysięgłych. A firsthand account of the trial, which was a vivid salutary drama, was published in the People ’ s Ancient and Just Liberties Assered (1670).
Admirał Penn zmarł w 1670 roku, ostatecznie pogodziwszy się z Kwakryzmem syna. Młody Penn odziedziczył posiadłości ojca w Anglii i Irlandii i stał się, podobnie jak ojciec, częstym gościem dworu, gdzie cieszył się przyjaźnią króla Karola II i jego brata, księcia Yorku (późniejszego Jakuba II). W 1672 Penn ożenił się z Gulielmą Springett, Kwakierką, z którą miał ośmioro dzieci, z których czworo zmarło w niemowlęctwie. W 1670 Penn był niestrudzenie aktywny jako minister kwakrów i polemik, tworząc nie mniej niż 40 kontrowersyjnych traktatów na temat doktryn i praktyk religijnych. W 1671 i 1677 podjął misje kaznodziejskie do Holandii i Północnych Niemiec, gdzie nawiązane przez niego kontakty pomogły mu później w zaludnieniu Pensylwanii tysiącami holenderskich i niemieckich emigrantów. Późniejsze lata dekady były również zajęte działalnością polityczną. W 1679 Penn poparł parlamentarną kandydaturę radykalnego republikanina Algernona Sidneya, idącego dwukrotnie—w Guildford, a później w Bramber—na rzecz swojego przyjaciela. W ciągu tych lat napisał szereg broszur w imieniu radykalnych Wigów, w tym wielkie zainteresowanie Anglii wyborem nowego parlamentu (1679), co jest godne uwagi jako jedno z pierwszych jasnych oświadczeń doktryny partyjnej kiedykolwiek przed angielskim elektoratem.