pepsyna, silny enzym w soku żołądkowym, który trawi białka, takie jak te w mięsie, jajach, nasionach lub produktach mlecznych. Pepsyna jest dojrzałą aktywną formą pepsynogenu (nieaktywnego białka).

pepsyna została po raz pierwszy uznana w 1836 roku przez niemieckiego fizjologa Theodora Schwanna. W 1929 jego krystalizację i charakter białek opisał amerykański biochemik John Howard Northrop z Rockefeller Institute for Medical Research. (Northrop otrzymał później nagrodę Nobla w dziedzinie chemii w 1946 roku za pracę nad skutecznym oczyszczaniem i krystalizacją enzymów.)

gruczoły w błonie śluzowej błony śluzowej żołądka wytwarzają i przechowują pepsynogen. Impulsy z nerwu błędnego i wydzieliny hormonalne gastryny i wydzieliny stymulują uwalnianie pepsynogenu do żołądka, gdzie miesza się go z kwasem solnym i szybko przekształca się w aktywny enzym pepsyny. Moc trawienna pepsyny jest największa przy kwasowości normalnego soku żołądkowego (pH 1,5-2,5). W jelicie neutralizowane są kwasy żołądkowe (pH 7), a pepsyna nie jest już skuteczna.

w przewodzie pokarmowym pepsyna powoduje tylko częściową degradację białek na mniejsze jednostki zwane peptydami, które następnie są wchłaniane z jelita do krwiobiegu lub są dalej rozkładane przez enzymy trzustkowe.

Niewielkie ilości pepsyny przechodzą z żołądka do krwiobiegu, gdzie rozkłada niektóre z większych lub częściowo niestrawionych fragmentów białka, które mogły zostać wchłonięte przez jelito cienkie.

przewlekły przepływ pepsyny, kwasu i innych substancji z żołądka do przełyku stanowi podstawę dla warunków refluksu, zwłaszcza choroby refluksu żołądkowo-przełykowego i refluksu krtaniowo-gardłowego (lub refluksu pozapłykowego). W tym ostatnim pepsyna i kwas podróżują aż do krtani, gdzie mogą powodować uszkodzenie błony śluzowej krtani i wywoływać objawy od chrypki i przewlekłego kaszlu do krtani (mimowolne skurcze strun głosowych) i raka krtani.

pepsyna jest wytwarzana komercyjnie z żołądków świń. Surowa pepsyna jest stosowana w przemyśle skórzanym do usuwania włosów i resztek tkanki ze skór zwierzęcych przed ich garbowaniem. Jest również stosowany w odzyskiwaniu srebra z odrzuconych filmów fotograficznych poprzez trawienie warstwy żelatyny, która zawiera związek srebra.