Terytorium Missouri po raz pierwszy złożyło wniosek o nadanie statusu państwowości w 1817 roku, a na początku 1819 roku Kongres rozważał wprowadzenie przepisów, które upoważniłyby Missouri do stworzenia konstytucji stanowej. Kiedy 13 lutego 1819 roku Rep. James Tallmadge z Nowego Jorku usiłował dodać anty-slawerską poprawkę do tego ustawodawstwa, doszło jednak do brzydkiej i żarliwej debaty na temat niewolnictwa i prawa rządu do ograniczenia niewolnictwa. Poprawka Tallmadge zakazywała dalszego wprowadzania niewolników do Missouri i przewidywała emancypację tych, którzy już tam byli, gdy osiągnęli wiek 25 lat. Poprawka przeszła do Izby Reprezentantów, kontrolowanej przez bardziej zaludnioną północ, ale nie powiodła się w Senacie, który był równo podzielony między wolne i niewolnicze Państwa. Kongres odroczył posiedzenie bez rozstrzygnięcia kwestii Missouri.

następnego lata znaczna część opinii publicznej na północy zebrała się na poparcie propozycji Tallmadge. Wiele z tych anty-Missouri nastrojów, jak to nazywano, wynikało z prawdziwego przekonania, że niewolnictwo było moralnie złe. Celowość polityczna miesza się z przekonaniami moralnymi. Wielu z czołowych anty-Missouri mężczyzn było aktywnych w Partii Federalistycznej, która wydawała się być w trakcie rozpadu; zarzucano im, że poszukują kwestii, w której mogliby odbudować swoją partię. Federalistyczne przywództwo grupy anty-Missouri spowodowało, że niektórzy północni Demokraci ponownie rozważyli swoje poparcie dla poprawki Tallmadge i opowiedzieli się za kompromisem, który udaremniłby wysiłki na rzecz ożywienia Partii Federalistycznej.

Po ponownym zwołaniu Kongresu w grudniu 1819 roku, Kongres stanął przed prośbą o nadanie statusu państwa z Maine. W tym czasie istniały 22 Stany, Z których połowa była wolna, a połowa niewolnicza. Senat uchwalił ustawę zezwalającą Maine na wstąpienie do Unii jako wolnego stanu, a Missouri na przyjęcie bez ograniczeń niewolnictwa. Sen. Jesse B. Thomas z Illinois dodał poprawkę, która pozwoliła Missouri stać się stanem niewolniczym, ale zakazała niewolnictwa w pozostałej części Luizjany na północ od szerokości geograficznej 36°30′. Henry Clay następnie umiejętnie poprowadził siły kompromisu, przygotowując oddzielne głosy w sprawie kontrowersyjnych środków. 3 marca 1820 roku decydujące głosy w Izbie uznały Maine za wolny stan, Missouri za stan niewolniczy i uczyniły wolną ziemię wszystkimi zachodnimi terytoriami na północ od południowej granicy Missouri.

Kiedy Konwencja Konstytucyjna Missouri upoważniła legislaturę stanową do wykluczenia wolnych czarnych i mulatów, jednak pojawił się nowy kryzys. Wystarczająco wielu kongresmenów z północy sprzeciwiło się przepisowi rasowemu, że Clay został wezwany do sformułowania drugiego kompromisu Missouri. 2 marca 1821 Kongres uznał, że Missouri nie może uzyskać wstępu do Unii, dopóki nie zgodzi się, że klauzula wyłączająca nigdy nie będzie interpretowana w taki sposób, aby skrócić przywileje i immunitety obywateli USA. Missouri zgodziło się na to I stało się 24 stanem 10 sierpnia 1821; Maine zostało przyjęte w poprzednim roku 15 marca.

chociaż niewolnictwo było problemem dzielącym Stany Zjednoczone od dziesięcioleci, nigdy wcześniej antagonizm sekcyjny nie był tak jawny i groźny, jak w kryzysie Missouri. Thomas Jefferson opisał strach, który wywołał, jako ” jak dzwonek w nocy.”Chociaż kompromisowe środki wydawały się rozstrzygać kwestię rozszerzenia niewolnictwa, John Quincy Adams zauważył w swoim dzienniku,” weź za pewnik, że teraźniejszość jest jedynie wstępem-stroną tytułową Wielkiego, tragicznego tomu.”Konflikt sekcyjny rozwinął się do punktu wojny secesyjnej po tym, jak kompromis Missouri został uchylony przez ustawę Kansas-Nebraska (1854) i został uznany za niekonstytucyjny w decyzji Dreda Scotta z 1857.