chondrocyt w macierzy chrzęstnej ma zaokrągloną lub wielokątną strukturę. Wyjątek występuje na granicach tkanek, na przykład na powierzchniach stawowych stawów, w których chondrocyty mogą być spłaszczone lub dyskoidalne. Cechy wewnątrzkomórkowe są charakterystyczne dla syntetycznie aktywnej komórki. Gęstość komórek pełnej grubości, ludzkiej, dorosłej chrząstki kłykciowej kości udowej utrzymuje się na poziomie 14,5 (±3,0) × 103 komórek/ mm2 w wieku od 20 do 30 lat. Chociaż starzenie chondrocytów występuje wraz ze starzeniem się, liczby mitotyczne nie są widoczne w normalnej dorosłej chrząstce stawowej. Struktura, gęstość i aktywność syntetyczna dorosłego chondrocyta są różne w zależności od jego pozycji. Spłaszczone komórki są zorientowane równolegle do powierzchni, wraz z włóknami kolagenowymi, w strefie powierzchownej, regionie o największej gęstości komórek. W strefie środkowej chondrocyty są większe i bardziej zaokrąglone i wykazują losowy rozkład, w którym włókna kolagenowe są również bardziej losowo rozmieszczone. W głębszych strefach chondrocyty tworzą kolumny, które są zorientowane prostopadle do powierzchni chrząstki, wraz z włóknami kolagenowymi. Chondrocyty mogą wykazywać różne zachowania w zależności od ich położenia w różnych warstwach. W pierwotnych hodowlach chondrocytów te strefowe różnice w właściwościach syntetycznych mogą się utrzymywać. Rzęski pierwotne mają istotne znaczenie dla orientacji przestrzennej komórek w rozwoju płytki wzrostu i są organellami czuciowymi w chondrocytach. Rzęski pierwotne działają jako centra sygnalizacji typu bezskrzydłego (Wnt) i Jeża i zawierają receptory mechanowrażliwe.