sammentringene av sirkulære og langsgående muskler reguleres av elektriske impulser som begynner med passasje av kalsiumioner i muskelcellen. Duodenal pacemaker sender elektriske impulser ned i tynntarmen med en hastighet på 11 sykluser per minutt i tolvfingertarmen, gradvis avtagende til 8 sykluser per minutt i ileum. Disse elektriske endringene forplantes i det langsgående muskellaget av tynntarmens vegg. Oppstår samtidig med langsom bølge elektrisk aktivitet kan være rask, spikelike elektriske ladninger. Denne typen elektrisk aktivitet stammer fra det sirkulære muskellaget i tarmveggen og oppstår når det sirkulære laget kontrakterer for å danne en segmenteringskontraksjon. Depolariseringen av muskelcellemembranene, eller et overskudd av positive ladninger på innsiden av cellen, får myofibrillene (de kontraherende komponentene i myofilamentene som utgjør muskelvevet) til å trekke seg sammen. Frekvensen av disse sammentrekningene styres av depolariseringen av muskelcellemembranen. De to spiralmuskellagene trekker seg da sammen, noe som forårsaker motoraktiviteten som tillater blanding og transport av maten i tynntarmen.

de primære formålene med tynntarmens bevegelser er å gi blanding og transport av intraluminalt innhold. En karakteristisk for tynntarmmotilitet er den iboende evne til glatt muskel som utgjør tarmveggen til å trekke seg spontant og rytmisk. Dette fenomenet er uavhengig av ytre nerveforsyning til tynntarmen. I myenterisk plexus (et nettverk av nervefibre i tarmveggen) finnes det flere andre messenger-stoffer og reseptorer som er i stand til å modulere glatt muskelaktivitet, inkludert somatostatin, serotonin (5-hydroksytryptamin) og enkefaliner. Med minst syv slike stoffer i og rundt glatt muskel, er det noe forvirring om deres respektive roller. Sammentringene i tynntarmen skaper trykkgradienter fra et tilstøtende segment av orgelet til et annet. Trykkgradientene er i sin tur primært ansvarlige for transport i tynntarmen. To typer motoraktivitet har blitt anerkjent: segmentering av sammentrekninger og peristaltiske sammentrekninger.

den dominerende motoriske virkningen av tynntarmen er segmenteringskontraksjonen, som er en lokalisert omkretskontraksjon, hovedsakelig av den sirkulære muskel i tarmveggen. Segmentering sammentrekninger blande, skille, og churn intestinal kymus. Sammentrekningen innebærer bare et kort segment av tarmveggen, mindre enn 1 til 2 cm (ca. 1 tomme), og innsnevrer lumen, som har en tendens til å dele innholdet. Når chymen beveger seg fra tolvfingertarmen til ileum, er det en gradvis reduksjon i antall segmenteringskontraksjoner. Dette har blitt beskrevet som «gradient» av tynntarmmotilitet. Selv om segmentering sammentrekninger vanligvis oppstår på en uregelmessig måte, kan de forekomme i en vanlig eller rytmisk mønster og med en maksimal hastighet for det aktuelle området av tynntarmen (rytmisk segmentering). Rytmisk segmentering kan bare forekomme i et lokalisert segment av tynntarmen, eller det kan forekomme på en progressiv måte, med hver etterfølgende segmenteringskontraksjon som forekommer litt under den foregående (progressiv segmentering).en peristaltisk sammentrekning kan defineres som en fremrykkende ring eller bølge av sammentrekning som passerer langs et segment av mage-tarmkanalen. Det skjer normalt bare over et kort segment (omtrent hver 6 cm) og beveger seg med en hastighet på ca 1 eller 2 cm per minutt. Denne typen motoraktivitet i tynntarmen resulterer i transport av intraluminal innhold nedover, vanligvis ett segment om gangen.

når en inflammatorisk tilstand i tynntarmen eksisterer, eller når irriterende stoffer er tilstede i intraluminalinnholdet, kan en peristaltisk sammentrekning bevege seg over en betydelig avstand av tynntarmen; dette kalles peristaltisk rush. Diare på grunn av vanlige infeksjoner er ofte forbundet med peristaltiske rushes. De fleste katartika produserer diarrheisk effekt ved å irritere tarmslimhinnen eller ved å øke innholdet, spesielt med væske.