Website designEdit

Una nuova interfaccia PubMed è stata lanciata nell’ottobre 2009 e ha incoraggiato l’uso di formulazioni di ricerca rapide e simili a Google; sono state anche descritte come ricerche “telegram”. Per impostazione predefinita, i risultati sono ordinati per Più recente, ma questo può essere modificato in Migliore corrispondenza, Data di pubblicazione, Primo autore, Ultimo autore, Diario o Titolo.

Il design e il dominio del sito web PubMed sono stati aggiornati a gennaio 2020 e sono diventati predefiniti il 15 maggio 2020, con le funzionalità aggiornate e nuove. C’è stata una reazione critica da parte di molti ricercatori che utilizzano frequentemente il sito.

PubMed per palmari/mobilesEdit

PubMed / MEDLINE è accessibile tramite dispositivi palmari, utilizzando ad esempio l’opzione “PICO” (per domande cliniche mirate) creata dall’NLM. Un’opzione “PubMed Mobile”, che fornisce l’accesso a un mobile friendly, versione semplificata PubMed, è inoltre disponibile.

SearchEdit

Standard searchEdit

Ricerche semplici su PubMed possono essere effettuate inserendo aspetti chiave di un soggetto nella finestra di ricerca di PubMed.

PubMed traduce questa formulazione di ricerca iniziale e aggiunge automaticamente nomi di campo, termini MeSH pertinenti (intestazioni di soggetti medici), sinonimi, operatori booleani e “annida” i termini risultanti in modo appropriato, migliorando significativamente la formulazione di ricerca, in particolare combinando abitualmente (usando l’operatore OR) parole di testo e termini MeSH.

Gli esempi forniti in un tutorial PubMed dimostrano come funziona questo processo automatico:

le Cause Sonno a Piedi si traduce come ” (“eziologia” O “eziologia” O “cause” O “causalità” O “causalità”) E (“sonnambulismo” O “sonnambulismo” O”sleep” E “a piedi”) O “sonno a piedi”)

allo stesso modo,

Attacco dolce di Aspirina per la Prevenzione si traduce come ” (“infarto del miocardio” O (“infarto” E “infarto”) O “infarto del miocardio” O”cuore” E “attacco”) O “attacco di cuore”) E (“aspirina” O “aspirina”) E (“prevenzione e controllo” O (“prevenzione” E “di controllo”) O “prevenzione e control” O “prevention”)

Ricerca completamodifica

Per ricerche ottimali in PubMed, è necessario comprendere il suo componente principale, MEDLINE, e in particolare del vocabolario controllato MeSH (Intestazioni di soggetti medici) utilizzato per indicizzare gli articoli MEDLINE. Possono anche richiedere strategie di ricerca complesse, l’uso di nomi di campo (tag), l’uso corretto dei limiti e altre caratteristiche; bibliotecari di riferimento e specialisti di ricerca offrono servizi di ricerca.

La ricerca nella finestra di ricerca di PubMed è consigliata solo per la ricerca di argomenti inequivocabili o nuovi interventi che non hanno ancora creato un’intestazione MeSH, nonché per la ricerca di marchi commerciali di farmaci e nomi propri. È utile anche quando non esiste un’intestazione adatta o il descrittore rappresenta un aspetto parziale. La ricerca utilizzando la MESH thesaurus è più accurata e darà meno risultati irrilevanti. Inoltre, salva lo svantaggio della ricerca a testo libero in cui devono essere prese in considerazione le differenze ortografiche, singolari/plurali o abbreviate. D’altra parte, non saranno trovati articoli più recentemente inseriti nella banca dati a cui non sono stati ancora assegnati descrittori. Pertanto, per garantire una ricerca esaustiva, è necessario utilizzare una combinazione di intestazioni linguistiche controllate e termini di testo libero.

Parametri dell’articolo del giornalemodifica

Quando un articolo del giornale viene indicizzato, numerosi parametri dell’articolo vengono estratti e memorizzati come informazioni strutturate. Tali parametri sono: Tipo di articolo (termini MeSH, ad esempio, “Studio clinico”), identificatori secondari, (termini MeSH), Lingua, Paese della Rivista o storia della pubblicazione (data di pubblicazione elettronica, data di pubblicazione della rivista stampata).

Tipo di pubblicazione: Clinical queries/systematic reviewsEdit

Il parametro del tipo di pubblicazione consente la ricerca in base al tipo di pubblicazione, inclusi rapporti di vari tipi di ricerca clinica.

IDEdit secondario

Dal luglio 2005, il processo di indicizzazione degli articoli MEDLINE estrae gli identificatori dall’abstract dell’articolo e li inserisce in un campo chiamato Identificatore secondario (SI). Il campo identificatore secondario è quello di memorizzare i numeri di adesione a vari database di dati di sequenza molecolare, espressione genica o composti chimici e ID degli studi clinici. Per gli studi clinici, PubMed estrae gli ID di prova per i due più grandi registri di prova: ClinicalTrials.gov (NCT identifier) e lo standard internazionale Randomized Controlled Trial Number Register (IRCTN identifier).

Vedi ancheedit

Un riferimento che è giudicato particolarmente rilevante può essere contrassegnato e “articoli correlati” possono essere identificati. Se pertinente, è possibile selezionare diversi studi e generare articoli correlati a tutti (su PubMed o su uno qualsiasi degli altri database NCBI Entrez) utilizzando l’opzione “Trova dati correlati”. Gli articoli correlati sono quindi elencati in ordine di “relazione”. Per creare questi elenchi di articoli correlati, PubMed confronta le parole dal titolo e dall’abstract di ogni citazione, nonché le intestazioni MESH assegnate, utilizzando un potente algoritmo ponderato per le parole. La funzione “articoli correlati” è stata giudicata così precisa che gli autori di un articolo hanno suggerito che potesse essere utilizzata al posto di una ricerca completa.

Mapping to MeSHEdit

PubMed si collega automaticamente ai termini e alle sottovoci della MeSH. Esempi potrebbero essere:” alito cattivo ” collegamenti a (e include nella ricerca)” alitosi”,” infarto “a” infarto miocardico”,” cancro al seno “a”neoplasie al seno”. Se del caso, questi termini MeSH vengono automaticamente “espansi”, ovvero includono termini più specifici. Termini come “infermieristica” sono automaticamente collegati a “Infermieristica” o “Infermieristica”. Questa funzione è chiamata Mappatura automatica dei termini e viene eseguita, per impostazione predefinita, nella ricerca a testo libero ma non nella ricerca esatta delle frasi (ovvero racchiudendo la query di ricerca con virgolette doppie). Questa funzione rende le ricerche PubMed più sensibili ed evita falsi negativi (mancati) colpi compensando la diversità della terminologia medica.

PubMed non applica la mappatura automatica del termine nelle seguenti circostanze: scrivendo la frase citata (ad esempio, “allotrapianto renale”), quando viene troncato sull’asterisco (ad esempio, allotrapianto renale*) e quando si guardano con etichette di campo (ad esempio, Cancro ).

il Mio NCBIEdit

PubMed opzionale facility “My NCBI” (con iscrizione gratuita) fornisce gli strumenti per la

• salvare le ricerche
• filtrare i risultati di ricerca
• impostare gli aggiornamenti automatici inviati via e-mail
• il risparmio di imposta di riferimenti richiamati come parte di un PubMed search
• configurazione dei formati di visualizzazione o evidenziando i termini di ricerca

e un’ampia gamma di altre opzioni. L’area “My NCBI” è accessibile da qualsiasi computer con web-access.An la versione precedente di” My NCBI “si chiamava”PubMed Cubby”.

LinkOutEdit

LinkOut, una funzione NLM per collegare (e rendere disponibile il testo completo) le partecipazioni di riviste locali. Circa 3.200 siti (principalmente istituzioni accademiche) partecipano a questa struttura NLM (a partire da marzo 2010), dall’Università di Aalborg in Danimarca a ZymoGenetics a Seattle. Gli utenti di queste istituzioni vedono il logo della loro istituzione all’interno del risultato della ricerca PubMed (se il giornale è detenuto in quell’istituzione) e possono accedere al testo completo. Link out è stato consolidato con lo strumento esterno a partire dal principale aggiornamento della piattaforma in arrivo nell’estate di 2019.

PubMed CommonsEdit

Nel 2016, PubMed consente agli autori di articoli di commentare gli articoli indicizzati da PubMed. Questa funzione è stata inizialmente testata in modalità pilota (dal 2013) ed è stata resa permanente nel 2016. A febbraio 2018, PubMed Commons è stato interrotto a causa del fatto che “l’utilizzo è rimasto minimo”.

askMEDLINEEdit

askMEDLINE, uno strumento di query in linguaggio naturale a testo libero per MEDLINE / PubMed, sviluppato da NLM, adatto anche per palmari.

PubMed identifierEdit

Un PMID (PubMed identifier o PubMed Unique identifier) è un valore intero univoco, a partire da1, assegnato a ciascun record PubMed. Un PMID non è lo stesso di un PMCID (PubMed Central identifier) che è l’identificatore per tutte le opere pubblicate in PubMed Central ad accesso libero.

L’assegnazione di un PMID o PMCID a una pubblicazione non dice al lettore nulla sul tipo o sulla qualità del contenuto. I PMID sono assegnati alle lettere all’editore, alle opinioni editoriali, alle colonne editoriali e a qualsiasi altro pezzo che l’editore sceglie di includere nella rivista, nonché ai documenti sottoposti a revisione paritaria. L’esistenza del numero di identificazione non è anche la prova che i documenti non sono stati ritirati per frode, incompetenza o cattiva condotta. L’annuncio su eventuali correzioni ai documenti originali può essere assegnato un PMID.