Gli organismi non patogeni sono quelli che non causano malattie, danni o morte a un altro organismo e vengono solitamente utilizzati per descrivere i batteri. Descrive una proprietà di un batterio-la sua capacità di causare malattie. La maggior parte dei batteri non sono patogeni. Può descrivere la presenza di batteri che causano malattie che normalmente risiedono sulla superficie di vertebrati e invertebrati come commensali. Alcuni microrganismi non patogeni sono commensali all’interno e all’interno del corpo degli animali e sono chiamati microbiota. Alcuni di questi stessi microrganismi non patogeni hanno il potenziale di causare malattie o di essere patogeni se entrano nel corpo, si moltiplicano e causano sintomi di infezione. Gli individui immunocompromessi sono particolarmente vulnerabili ai batteri che sono tipicamente non patogeni ma a causa di un sistema immunitario compromesso, la malattia si verifica quando questi batteri ottengono l’accesso all’interno del corpo. Sono stati identificati geni che predispongono la malattia e l’infezione da batteri non patogeni da un piccolo numero di persone. Non patogenico E.i ceppi di coli normalmente presenti nel tratto gastrointestinale hanno la capacità di stimolare la risposta immunitaria negli esseri umani, sebbene siano necessari ulteriori studi per determinare le applicazioni cliniche.
Un particolare ceppo di batteri può essere non patogeno in una specie ma patogeno in un’altra. Una specie di batterio può avere molti tipi o ceppi diversi. Un ceppo di una specie di batterio può essere non patogenico e un altro ceppo dello stesso batterio può essere patogeno.