==metabolia==aineenvaihdunta on kaikki kemialliset reaktiot, joita eliö tarvitsee pysyäkseen hengissä. Lähes kaikki näistä reaktioista ovat entsyymin katalysoimia. Entsyymien rooli aineenvaihdunnassamme voidaan jakaa: ”anaboliset entsyymit” katalysoivat kemiallisia reaktioita, joissa muodostuu sidoksia. Entsyymi sitoutuu väliaikaisesti substraattimolekyyleihin ja vie ne orientaatioon, jolloin niiden välille muodostuu sidos. Näitä reaktioita tarvitaan suurempien molekyylien ja kemiallisten rakenteiden rakentamiseen. ”Kataboliset entsyymit” katalysoivat kemiallisia reaktioita, joissa sidokset katkeavat. Entsyymi sitoutuu väliaikaisesti substraattimolekyyliin ja lisää olemassa olevaan sidokseen kohdistuvaa stressiä, kunnes se katkeaa. Näitä reaktioita tarvitaan suurempien molekyylien hajottamiseen niiden kemiallisiin osiin. Ruoansulatusentsyymit ovat katabolisia, ne hajottavat suurempia kemiallisia aineita pienemmiksi liukoisiksi molekyyleiksi, joita voidaan käyttää rakennusaineina kasvuun ja korjaukseen.= = Biokemiallinen reitti= = biokemiallinen reitti (kutsutaan myös ”’metaboliareitiksi”’) on entsyymivälitteisten reaktioiden sarja, jossa yhden reaktion tuotetta käytetään substraattina seuraavassa.Jokaista entsyymiä koodaa eri geeni. Esimerkiksi, lets olettaa ”’entsyymi A ”’on koodattu ”’geeni a”’. Samoin”’ entsyymi B ”’on koodattu”’geeni B”’. Tässä esimerkissä oletetaan, että entsyymi a muuntaa valkoisen yhdisteen (kemiallinen 1) ruskeaksi yhdisteeksi (kemiallinen kaksi). Entsyymi B käyttää tämän jälkeen ruskeaa yhdistettä substraattinaan ja muuntaa sen mustaksi yhdisteeksi (kemiallinen 3). Jotta hiirellä olisi musta fenotyyppi, sillä täytyy olla sekä ”A” – että ”B” – geenit. Jos hiirellä on vain A-geeni, ruskea yhdiste kerääntyy ja sillä on ruskea fenotyyppi. Jos hiirellä on vain B-geeni, valkoinen yhdiste kerääntyy ja B-geenin vaikutus peittyy (vaikka entsyymiä B esiintyy, sillä ei ole substraattia, johon vaikuttaa).”Mutaatio” geenin sisällä johtaa usein epäfunktionaaliseen entsyymiin. Tämä itsessään ei yleensä vaikuttaisi biokemialliseen kulkureittiin, koska useimmat mutaatiot ovat resessiivisiä ja normaali (dominoiva) alleeli tuottaisi silti toimivan entsyymin. Jos hiirellä on vähintään yksi toimiva ”A” – ja ”B” – geeni, syntyy lopullinen (musta) tuote. Jos hiiri perii kaksi mutanttia ”b”-alleelia (ei-funktionaalista), ruskea yhdiste kerääntyy. Jos hiiri perii kaksi mutanttia” a ” -alleelia (ei-toiminnallisia), valkoinen yhdiste kerääntyy. Tämä voidaan tiivistää seuraavasti (vas.).= = Feedback Inhibition= = monissa biokemiallisissa reiteillä lopputuote toimii ”entsyymin inhibiittorina” estäen ensimmäisen entsyymin toimintaa. Tätä kutsutaan ”takaisinkytkennän inhibitioksi” ja se toimii mekanismina, joka estää lopullisen tuotteen liiallisen kertymisen. Usein alkuperäistä substraattia voidaan käyttää myös muissa biokemiallisissa väylissä ja takaisinkytkennän esto varmistaa myös, ettei se mene hukkaan.= = = Biokemialliset reitit ihmisillä = = biokemialliset reitit ihmisen soluissa ovat melko monimutkaisia monien monien risteävien reittien kanssa. Fenotyyppimme johtuu lopulta geeniemme koodaamien proteiinien monimutkaisesta vuorovaikutuksesta. Alla on kaavio, joka havainnollistaa monia tunnettuja biokemiallisia reittejä ihmisillä.