græsk ekspansion blev midlertidigt kontrolleret af de persiske invasioner mellem 514 og 497 f.kr., i hvilket tidsrum Thrakien blev besat af styrkerne fra Darius I og hans efterfølger. Mange subjektbyer gjorde oprør og blev hjulpet af Sparta, der førte krig mod Athenerne (den Peloponnesiske Krig 431-404 f.kr.) og til sidst besejrede dem.
i det 4.århundrede f. kr. udnyttede den makedonske konge Philip II, far til Aleksander den store, de græske staters uenighed for at udvide sig til Thrakien og derefter tage kontrol over Grækenland.
i den hellenistiske periode hævdede efterfølgere af Aleksander den store, såsom Lysimachus (se Pergamon fotogalleri 2, Side 3) at være Konger af Thrakien. Normalt regerede de kun over helleniserede kystområder, mens deres herredømme konstant blev udfordret af thrakiske kongeriger som Seuthes III.
uundgåeligt blev den thrakiske kultur påvirket af grækerne og senere de altbesejrende romere, der gjorde Thrakien til en provins i deres imperium i 46 E.kr. Meget lidt skriftligt vidnesbyrd fra Thrakerne selv har overlevet, og det meste af det, vi ved om dem, blev skrevet af græske og romerske forfattere.
På trods af de græske, makedonske og romerske erobringer blev meget af det, der var thrakisk territorium langs landstrimlen fra Halkidiki til Bysantium, fortsat omtalt af gamle forfattere og i inskriptioner som Thrakien.
med ankomsten af kristendommen og derefter Islam, og de stadige invasioner af mennesker fra andre kulturer, især slaver og osmanniske tyrker, den gamle hedenske thrakiske kultur forsvandt sammen med sprogene i de mennesker, der boede her.
Den østlige del af det romerske imperium blev det, der i dag er kendt som det bysantinske Imperium, med sin hovedstad i Konstantinopel (tidligere Bysantium, nu Istanbul) i det østlige Thrakien. Imperiet blev truet af mange krige og invasioner, især af bulgarere og korsfarere.
de osmanniske tyrker erobrede dele af Thrakien i 1354 og etablerede deres første hovedstad i Europa på Didymoteicho i 1361 (se foto nedenfor). I 1366 flyttede de deres hovedstad til den romersk-grundlagde by Adrianogle (i dag Edirne), før de tog Konstantinopel i 1453. I den osmanniske periode blev området afgjort af albanere, tyrkere, bulgarere, romaer og sefardiske jøder.
i løbet af det 19.århundrede blev Thrakien en vigtig producent af tobak og silke med byen Soufli som et lokalt centrum for silkefremstilling. I dag har Soufli to silkemuseer.
stigningen af Balkan nationalisme i det 19.århundrede førte til den græske uafhængighedskrig, Balkankrigene fra 1912-1913 og Første Verdenskrig. De forskellige etniske grupper, der havde kæmpet sammen for uafhængighed fra Tyrkiet – inklusive albanere, bulgarere, grækere og serbere – fortsatte med at kæmpe indbyrdes for kontrol over de befriede territorier. Dette forårsagede enorme lidelser for befolkningen i regionen, især for etniske grupper, der var mindretal på en anden gruppes territorium.
efter Første Verdenskrig fastsatte internationale konferencer og traktater grænser for Balkanstaterne, hvilket resulterede i opdeling af det historiske område Thrakien i tre dele: det nordlige Thrakien, langt den største del, blev en del af Bulgarien; Det vestlige Thrakien, mellem Ksanthi og Evros-floden, gik til Grækenland; Det Østlige Thrakien, øst for Evros til Bosporus, forblev Tyrkisk (i dag en del af Marmara-regionen).
den tvungne befolkningsudveksling mellem Grækenland og Tyrkiet i 1920 ‘ erne betød, at mange grækere ankom til Thrakien som flygtninge fra Tyrkiet. Mange mennesker, der befandt sig på den forkerte side af de nye grænser, valgte eller blev presset til at emigrere, en proces, der fortsatte ind i slutningen af det 20.århundrede. På trods af disse vandringer, græsk Thrakien er fortsat et af de mest etnisk blandede områder på Balkan.
siden slutningen af det 19.århundrede har der været en gradvis stigning i interessen for og revurdering af den thrakiske arv, og dens rester bliver udgravet mange steder omkring det sydlige Balkan, især i Bulgarien.
I Vestthrakien er der ingen store arkæologiske museer eller spektakulære steder, selvom der er nogle beskedne steder af historisk interesse, herunder ruinerne af de gamle mure omkring Didymoteicho (se et foto af byens moske fra det 15.århundrede nedenfor), det bysantinske slot ved Pythio, et par små steder (se arkæologiske steder nær Aleksandroupoli) og flere thrakiske grave. Udover Det Arkæologiske Museum Komotini og silkemuseerne i Soufli er der også små etnologiske (folklore) museer i Aleksandroupoli og Didymoteicho. Der er også mange gamle kirker, moskeer og traditionelt byggede huse i regionen.
Se også: en kort historie om Aleksandroupoli, Thrakien
