bygget i løbet af 1941-43, Pentagon var beregnet til at konsolidere kontorerne for Krigsafdelingen, som havde besat 17 separate faciliteter i hele USA. Selvom præsident Franklin D. Roosevelt oprindeligt foretrak en bygning uden vinduer for at beskytte den mod potentielle luftangreb, blev han senere overbevist af bygningsingeniører om, at et sådant anlæg ville være upraktisk. Han støttede til sidst et femsidet design af George Bergstrom-skønt Gilmore Clarke, formanden for Kommissionen for kunst, hvis kontor var tiltalt for at rådgive præsidenten og Kongressen om føderalt finansierede kunstneriske og offentlige strukturer, kritiserede det som “et af de mest alvorlige og værste angreb på planen.”Det valgte sted var for det meste et sumpet ødemark, hvis eneste struktur var den lille, forældede lufthavn. For at stabilisere området, omkring 5,5 millioner kubikmeter (4.2 millioner kubikmeter) snavs blev lastet ind, og 41.492 betonpæle blev sat til at understøtte bygningens fundament. For at beskytte udsigten til nabolandet Arlington National Cemetery var Pentagons højde strengt begrænset til 77 fod 3,5 tommer (24 meter). Med landets indtræden i Anden Verdenskrig i December 1941, kun tre måneder efter byggestart i September, blev færdiggørelsen af bygningen en national prioritet. Mere end 13.000 arbejdere arbejdede dag og nat, og inden for kun otte måneder efter banebrydende flyttede krigsminister Henry Stimson sine kontorer til det nye anlæg.ved færdiggørelsen til en pris af $83 millioner i januar 1943 var Pentagon verdens største kontorbygning, der dækkede 29 hektar (12 hektar)—inklusive en 5 hektar (2 hektar) Central domstol-og indeholdt omkring 3.700.000 kvadratfod (344.000 kvadratmeter) brugbar gulvplads til cirka 25.000 mennesker. Planer om at konvertere bygningen til et hospital eller et andet fredstidsfacilitet efter krigen blev opgivet med den hurtige begyndelse af Den Kolde Krig, hvilket krævede en høj grad af militært beredskab. Pentagon er fortsat en af verdens største kontorbygninger.

Konstrueret af stål og armeret beton med noget kalksten vendt, strukturen har fem etager, undtagen dens loft og kælder. Den består af fem koncentriske pentagoner eller” ringe ” med 10 spokelike korridorer, der forbinder hele. Der er 17,5 miles (28 km) korridorer, men på grund af sin innovative konstruktion er det muligt at gå mellem to punkter i bygningen på cirka syv minutter. Flere biblioteker fungerer som forskningsfaciliteter for militæret, og disse arkiver abonnerer på mere end 1.700 tidsskrifter på en lang række sprog. To cafeterier, en spisestue og syv snackbarer er også placeret på stedet. Der er 67 hektar (27 hektar) parkeringspladser, der kan rumme omkring 8.700 biler. Bus-og busterminaler er placeret under en enorm hal, der indeholder et indkøbscenter for Pentagon-medarbejdere. Den amerikanske Metro betjener også anlægget, og en heliport blev tilføjet i 1956.

i 2001, på 60-årsdagen for Pentagons banebrydende, kaprede fem terrorister et kommercielt passagerfly og piloterede det ind i bygningen under angrebene den 11.September. En del af den sydvestlige side af bygningen blev ødelagt, og 189 mennesker, herunder terroristerne, blev dræbt. Skaden blev stort set repareret inden for et år.