Alchymista vypráví příběh mladého pastýře jménem Santiago, který je schopen najít poklad, nad jeho nejdivočejší sny. Při cestě se učí naslouchat svému srdci a, co je důležitější, uvědomuje si, že jeho sny, nebo jeho osobní Legenda, nejsou jen jeho, ale součástí duše vesmíru.

Santiago je pokorný pastýř, jehož touhy jsou málo–chce být volný, aby se toulat s jeho ovce, máte nějaké víno v jeho měch a kniha v jeho tašce. Osud však zasahuje v podobě opakujícího se snu o velkém pokladu ukrytém tisíce kilometrů daleko na úpatí egyptských pyramid. Když se Santiago setká s Melchizedekem, podivným moudrým mužem, který tvrdí, že je králem z daleké země, rozhodne se hledat svůj poklad. Druhý den Santiago prodá své ovce a vydá se do Afriky za svým snem.

po příjezdu do Afriky je však zřejmé, že to nebude tak snadné, jak si myslel. První den je Santiago v Tangiers, je okraden a zůstal úplně sám, neschopný mluvit jediné slovo arabštiny. Santiago zpočátku uvažuje o tom, že se vzdá a otočí se. Vzpomíná si na slova moudrého muže, ačkoli, a rozhodne se pokračovat-získat práci v místním obchodě s krystaly. Poté, co pracoval rok v obchodě crystal, naučil se hodně o životě ao své osobní legendě, Santiago vydělává dost peněz, aby si koupil nové stádo ovcí a vrátil se domů. Na poslední chvíli, ačkoli, Santiago se rozhodne riskovat všechno a připojit se k karavanu do Egypta.

jednou v karavanu se Santiago setká s Angličanem, který přišel celou cestu do Afriky, aby hledal renomovaného alchymistu. Když cestují pouští, Angličan vypráví Santiagovi o tajemstvích alchymie. Santiago považuje myšlenky Angličana za velmi podobné Melchizedekovým. oba hovoří o duši světa, se kterou jsme všichni spojeni, a o nutnosti následovat skutečné touhy našeho srdce nebo naši osobní legendu. Santiago však dává přednost tomu, aby se tato tajemství naučila pozorováním světa, zatímco Angličan dává přednost učení se ze složitých knih. Zatímco cestují, začnou slyšet zvěsti o nadcházející kmenové válce.

Když konečně dorazí do oázy Al-Fayoum–domu titulárního alchymisty–Santiago potká krásnou dívku jménem Fatima, do které se okamžitě zamiluje. Zjistí, že láska, stejně jako osobní legenda, pochází přímo z duše světa. Při chůzi v poušti má Santiago vizi nadcházející bitvy. Spěchá zpět, aby varoval starší v oáze, a když se jeho vize potvrdí, nabídnou mu pozici poradce. Santiago zvažuje pobyt v oáze s Fatimou, ale Alchymista najde Santiaga a řekne mu, že povede Santiaga ke svému pokladu.

Alchymista opět na cestách učí Santiaga poslouchat jeho srdce. Srdce mohou být zrádná, ale nejlepší způsob, jak jim zabránit v tom, aby vás oklamali, je pozorně je poslouchat. Téměř k pyramidám jsou Santiago a alchymista zajati bojujícím kmenem. Alchymista říká kmenům, že Santiago je mocný kouzelník, který se může proměnit ve vítr. Domorodci jsou ohromeni a ušetří životy mužů, pokud to Santiago dokáže. Jediným problémem je, že Santiago netuší, co dělá. Po třech dnech meditace Santiago využívá své znalosti duše světa, aby požádal prvky, aby mu pomohly. Nejprve se zeptá pouště, pak se zeptá větru, pak se zeptá slunce a nakonec se zeptá duše světa. Okamžitě, vítr bičuje, a Santiago zmizí a znovu se objeví na druhé straně tábora.

Alchymista odejde ze Santiaga, který pokračuje k pyramidám. Jakmile tam, Santiago je napaden lupiči. Na otázku, co tam dělá, Santiago odpoví, že měl sen o pokladu pohřbeném na základně Pyramid. Jeden z lupičů se mu směje a říká, že měl přesně stejný sen, kromě toho, že v jeho pokladu byl pohřben ve Španělsku. Santiago si uvědomuje, že poklad byl po celou dobu ve Španělsku.

příběh pak skočí vpřed v čase a zjistí, že Santiago vykopává díru na základně stromu, kde měl svůj první sen. Jistě, najde kufr plný zlata-dost na to, aby on a Fatima žili šťastně po dlouhou dobu.